太医院：
主官
- 院使：一人，正五品，负责考察院属各科医务官员的业务才能，并率御医、吏目、医士等为帝后、王公大臣等治疗疾病。
- 院判：二人，正六品，佐院使掌院务。
属官
- 御医：最初四人，后增至十八人，隆庆五年最终确定为十人，正八品，各精一科，专为皇帝、后妃等治疗疾病。
- 吏目：一人，从九品，隆庆五年定设十人。
其他机构
- 生药库：设大使、副大使各一人，未入流，负责掌管药物。
- 惠民药局：设大使、副使各一人，未入流，主要为贫苦百姓提供医疗服务。
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洪武朝翰林院，洪武十八年（1385年）更定后：
主官
- 翰林学士：一人，正五品。
学士类
- 侍读学士、侍讲学士：各二人，从五品。
讲读类
- 侍读、侍讲：各二人，正六品。
其他文职类
- 五经博士：九人，正八品，且职位世袭。
- 典籍：二人，从八品。
- 侍书：二人，正九品。
- 待诏：六人，从九品。
- 孔目：一人，未入流。
史官类
- 修撰：三人，从六品。
- 编修：四人，正七品。
- 检讨：四人，从七品。
储备人才类
- 庶吉士：员额不定，无品级。
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国子监：
主官
- 祭酒：一人，从四品，掌国学诸生训导之政令等。
- 司业：一人，正六品，协助祭酒总理太学政事等。
绳愆厅
- 监丞：一人，正八品，负责监督并执行监规，纠正师生过失。
博士厅
- 五经博士：五人，从八品，分别讲授《易》《诗》《书》《春秋》《礼记》，同时兼习《大学》《中庸》《论语》《孟子》，并负责按时考核学生的学习进度。
六堂
- 助教：每堂十五人，从八品，负责各堂的教学与训导。
- 学正：每堂十人，正九品，掌执行学规，考校训导。
- 学录：每堂七人，从九品。
典簿厅
- 典簿：一人，从八品，负责管理文书、财务等事务。
- 典籍：一人，从九品。
掌馔厅
- 掌馔：二人，未入流，负责饮食安排。
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五军都督府:指中军，左军，右军，前军，后军。
都督府主官
- 左、右都督：正一品。
- 都督同知：从一品。
- 都督佥事：正二品。
经历司
- 经历：从五品。
- 都事：从七品。
断事司
- 洪武十七年，五军各设左、右断事二人，提控案牍一人，均为从九品。
- 洪武二十三年，升五军断事官为正五品，总治五军刑狱，分为五司，司设稽仁、稽义、稽礼、稽智、稽信五人，俱正七品，各理其军之刑狱。
照磨所
洪武二十九年，置五军照磨所，设照磨等官职，专掌文牍，但具体品级不详。
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卫指挥使司：
卫指挥使司主官
- 指挥使：正三品，是卫所的最高长官，全面负责卫所的军事、行政等事务。
- 指挥同知：从三品，通常设二人，协助指挥使处理卫所事务。
- 指挥佥事：正四品，协助指挥使和指挥同知管理卫所各项工作。
镇抚司
- 卫镇抚：从五品，负责卫所的司法、治安等事务，维持卫所内部的秩序。
经历司
- 经历：从七品，负责处理卫指挥使司的文书、档案等事务，是卫所内部重要的文职官员。
- 知事：正八品，协助经历处理日常事务。
- 吏目：从九品，负责具体的文书工作和一些杂务。
其他属官
包括仓大使、副使等，负责卫所的仓储、后勤等事务，品级通常较低，未入流或从九品以下。
亲军卫指挥使司指的是：“锦衣卫指挥使司，金吾左卫、金吾右卫、羽林前卫。”
地方卫指挥使司指的是：“北平都司、陕西都司、山西都司、山东都司、浙江都司、江西都司、四川都司、福建都司、湖广都司、广东都司、广西都司、辽东都司、河南都司。
陕西行都司、山西行都司、福建行都司、四川行都司、湖广行都司。”
特殊卫指挥使司：“中都留守司（专门守护黄陵）”
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千户所：
千户所主官
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